4種類のデザインが用意されたこのシャトルバスは市交通局が運行し、開館日から小田急線及びJR南武線の登戸駅とミュージアムを結ぶもの。今回のお披露目式では中型と小型それぞれ2台ずつ、計4台が披露された。車両ごとに異なった藤子・F・不二雄作品のキャラクターを活用したラッピングと内装が施されている。
各シャトルバスのテーマは中型の1号車が「ドラえもん」、2号車が「オバケのQ太郎」、小型の3号車が「キテレツ大百科」、4号車が「パーマン」。
なお、9月3日以降の運行日は「藤子・F・不二雄ミュージアム」開館日に合わせた運行で、原則火曜日と年末年始は運休となる。